Ecclesia militans se veut une collection d’histoire de l’Eglise et du christianisme dans l’Europe latine (au sens culturel) de la fin du IVe siècle (christianisation officielle de l’Empire romain) jusqu’au milieu du XVIe siècle (réformes ecclésiologiques alternatives). Des approches comparatistes, notamment avec les christianismes orientaux, ne sont pas exclues. La collection a vocation à accueillir des monographies et des ouvrages collectifs, les directeurs se réservant de retrancher de ces derniers les contributions qu’ils jugeront insuffisantes.
La collection entend publier les résultats de travaux qui se situent aux intersections de l’histoire des hommes (individus et groupes sociaux) et des institutions ecclésiastiques, dans leurs dimensions religieuse, ecclésiologique, politique, sociale et culturelle. Les ouvrages analyseront les grandes évolutions, mais pourront aussi décrypter des évènements plus ponctuels, mais emblématiques de tendances globales.